Other activities

Responsabilities
Since 1990: JY Sire is the leader of the research group "Evolution & development of the skeleton"
1995-... moved to UMR 7138 (Dir. Prof. Hervé Le Guyader)

Composition of the research group : January 2014

Jean-Yves Sire, DR2, CNRS
Sidney Delgado, MCU, UPMC
Tiphaine Davit-Béal, MCU-PH, Univ. Paris5

Marie-Claire Lajarille, Adjoint technique, UPMC

Barbara Gasse, PhD, CNRS, Enamel matrix proteins
Amandine Leprévost, PhD, CIFRE, Development of axial skeleton and scutes of sturgeon, Acipenser baeri

Publications in other journals [Top]
Les Biominéralisations, témoins de l’évolution du vivant.
Ameziane N, Auzoux-Bordenave S, Caraguel JM, Domart-Coulon I, Lopez PJ, Luquet G, Martin S, de Rafélis M, Segalen L. Sire JY
(2013) Le courrier de la Nature, 275: 29-37.

Redéfinition du rôle de pTa au sein du pré-TCR. Les leçons de l’analyse moléculaire de pTa chez nos ancêtres.
Smelty P, Marchal C, Jaffredo T, Sire JY, Fellah JS
(2011) Medecine & Sciences 27(4): 346-348.

Chez les amniotes, MEPE est impliquée dans la minéralisation de trois tissus: la dentine, l'os et la coquille d'oeuf.
Bardet C, Sire JY
(2010) Cahiers de l'ADF 26: 4-12

Analyse évolutive de MEPE chez les mammifères.
Bardet C, Sire JY
(2009) Cahiers de l'ADF 25: 10-21

Canines et génétique: mythe ou réalité?
Bloch-Zupan A, Sire, JY
(2009) Revue Francophone d'Odontologie Pédiatrique 4(1): 41-46.
[PDF]

Analyse évolutive de l’énaméline chez les tétrapodes : mise en évidence de régions fonctionnelles et aide à la validation de mutations conduisant à l’amélogénèse imparfaite de type 2.
Delgado S, Davit-Béal T, Al-Hashimi N, Sire JY
(2007) Cahiers de l'ADF, 10 (22-23): 33-42.

L'analyse évolutive moléculaire: un outil de validation pour le diagnostic des pathologies génétiques héréditaires liées aux protéines dentaires.
Delgado S, Davit-Béal T, Sire JY
(2005) Cahiers de l'ADF, 8(18-19): 34-42.

Book chapters [Top]
12. Origin and evolution of bone and dentin, and of their phosphorylated, acid-rich matrix proteins.
Sire JY, Kawasaki K
(2012) In: Phosphorylated Extracellular Matrix Proteins of bone and dentin (M. Goldberg, ed.), pp. 3-58. e-book series: Bentham Science Publishers Ltd.

11. Origin and relationships of amelogenin, and the evolutionary analysis of
its conserved and variable regions in tetrapods
Sire JY
(2010). In: Amelogenins: Multifaceted Porteins for Dental & Bone Formation & Repair (Goldberg M., ed.), pp. 1-18. e-book series: Bentham Science Publishers Ltd

10. Amelogenin exons 8 and 9
Li W, Sire JY, Takan 3, MacDougall M, Goldberg M, DenBesten P
(2010). In: Amelogenins: Multifaceted Porteins for Dental & Bone Formation & Repair (Goldberg M., ed.), pp. 163-173. e-book series: Bentham Science Publishers Ltd

9. Origine, évolution et diversité des tissus dentaires.
Sire JY
(2010). In: EMC (Elsevier Masson SAS, Paris), Médecine buccale, 28-085-P-10

8. Le squelette de la truite arc-en-ciel.
Deschamps MH, Meunier F, Sire JY
(2010) In: Bases biologiques de l’élevage de la truite arc-en-ciel (Jalabert B, ed.). Editions QAE

7. Approche phylogénétique des Polyptériformes (Pisces, Cladistia).
Gayet M, Meunier FJ, Sire JY
(1995) Géobios, mém. spéc.19: 193-200.

6. Biomineralization in the integumental skeleton of the living lower Vertebrates.
Zylberberg L, Géraudie J, Meunier FJ, Sire JY
(1992) In: Bone - Bone metabolism and mineralization (Hall BK, ed.), Vol. 4: 171-224. CRC Press Inc.

5. Microstructure and mineralization of vertebrate skeletal tissues.
Francillon-Vieillot H, Buffrénil V De, Castanet J, Géraudie J, Meunier FJ, Sire JY, Zylberberg L., Ricqles A.de
(1990) In: Skeletal Biomineralization: Patterns, Processes and Evolutionary Trends (Carter JG, ed.). Short Course in Geology, Vol. 5, Pt II: 175-234.

4. Ontogenesis and regeneration as means of studying fish scales evolution.
Géraudie J, Meunier FJ, Sire JY, Zylberberg L
(1988) In: Proceedings of the 6th M. Singer Symposium (Inoue et al., eds): 23-33.

3. Données ultrastructurales sur la ganoine du dermosquelette des Actinoptérygiens primitifs.
Meunier FJ, Gayet M, Géraudie J, Sire JY, Zylberberg L
(1987) In: VIIth Int. Symp. on Dental Morphology (Russell DE et al., eds). Mémoires du. Muséum nat. Hist. nat., Paris, 53: 77-83.

2. Growth and determination of individual age of Turbo setosus (Prosobranchia Turbinidae), Hao atoll (Tuamotu, French polynesia).
Villiers L, Sire JY
(1985) In: Proceedings of the Vth International Coral Reef Congress, Tahiti, Vol. 5: 165-170.

1. The deep scleroblast of the regenerating teleost scale: a model of cell producing a collagenic plywood.
Sire JY
(1985) In: Biology of Invertebrate and Lower Vertebrate Collagens (Bairati A & Garrone R, eds), pp. 465-470. Plenum Press.

Editorial work [Top]

Editor in chief of Cybium, International Journal of Ichthyology
Since 1987
International Board, 8 associate editors. Indexed in Current Contents since 1998.
(4 issues/year, 400 pages), Fr/Eng.

Guest editor of:
The integument
(co-editor: M. Vickaryous)
(2009) Journal of Anatomy, Special issue, 214(4), 11 articles : 236 pages

Editor of:
Proceedings: 1ères Rencontres de l’Ichtyologie en France, RIF2000.
Paris, 2000 (co-editor: M. Gayet, Lyon).
(2000) Cybium, suppl. 160 p.

Proceedings: 3rd European Elasmobranch Assoiation Meeting,
Boulogne-sur-mer, 1999 (co-edito:r B. Séret, IRD)
(2000), 90 p.

Proceedings: XXIe Journées de la Société Française d'Ichtyologie.
Biarritz 1997 (co-editor: T. Boujard, INRA).
(1999) Cybium, suppl., 160 p.

Proceedings: Vth Indo-Pacific Conference,
Nouméa, 1997 (co-editor: B. Séret, IRD).
(1999), Société Française d'Ichtyologie, 888 p.

Proceedings: XXe Journées de la Société Française d'Ichtyologie.
Paris, 1996.
(1997) Cybium, suppl., 160 p.

Proceedings: XIXe Journées de la Société Française d'Ichtyologie.
Rennes,1995 (co-editor: J.L. Baglinière, INRA).
Cybium (1996), suppl., 140 p.

Quoy & Valenciennes.
(1994) Cybium, suppl., 80 p.

Faune characoide de l’Oyapock.
(1991) Cybium, suppl.

Morphologie fonctionnelle du tégument écailleux
(co-editor: F.J. Meunier, MNHN). Traduction française du livre russe de V.D. Burdak.
(1986) Cybium, suppl.

Meeting organizations [Top]
Cinquièmes Rencontres de l’Ichtyologie en France (RIF 2012).
(2012) Paris, Mars. Congrès national. (Organisateur principal). 200 personnes.

Journées Françaises de Biologie des Tissus minéralisés (JFBTM).
(2011) Paris, Mai. Colloque national (Organisateur principal). 200 personnes.

Quatrièmes Rencontres de l’Ichtyologie en France (RIF 2009).
(2009) Paris, Mars. Congrès national. (Organisateur principal). Plus de 150 personnes.

Symposium "Integument Story".
(2007) Paris, Juillet. (Co-organization: M. Vickaryous, Univ. Guelph, Canada) In: 8th International Congress of Vertebrate Morphology.

Deuxièmes Rencontres de l’Ichtyologie en France (RIF 2003).
(2003) Paris, Mars. Congrès national. (Organisateur principal). Plus de 150 personnes.

Premières Rencontres de l’Ichtyologie en France (RIF 2000).
(2000) Paris, Mars. Congrès national. (Fondateur et Organisateur principal). Plus de 150 personnes.

Worskshop “ Evolution ”.
(1999) Gand, sept. In: European Program COST B8 “ Odontogenesis ” (Co-organization: A. Huysseune, Univ. Gand, Belgique). 30 personnes

Invited talks [Top]
Evolution of the enamel genes.
(2007) European Training Course, COST B23, Paris, Oct.

Origine et évolution des protéines minéralisantes.
(2006) 9èmes JFBTM, Lyon, mai.

Origin and evolution of enamel mineralization genes.
(2006) IADR, Brisbane, Australie, juin.

Late development of fish scales and skin deifferentiation.
(2006) 1st Europ. Evo-Devo meeting, Prague, August.

Origin and evolution of enamel mineralization genes.
(2006) Colloque RST, Dijon, December.

Amelogenin: lessons from evolution.
(2004) 8th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, York, UK, juillet.

Formation of skeletal and dental tissues: A comparative and evolutionary approach.
Sire JY, Huysseune A
(2001) 6th Int. Cong. Vert. Morphol., Jena, July 201. (conf. Symp.). J. Morphol., 248(3): 285.

Evolution et développement du squelette dermique des vertébrés.
(2000) 3èmes Journées de la biologie des tissus minéralisés. Arcachon, mai. (conf. plénière).

Origine évolutive du dermo-squelette post-crânien des Vertébrés.
(1997) Colloque 1997, SFBD, Développement & Evolution, Dourdan, mai. Int. J. Dev. Biol., (oral)

Evolution of patterns and processes in teeth and tooth-related tissues in non-mammalian vertebrates.
Huysseune A., Sire JY
(1997) VIth Intern. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Goteborg, juin. European Journal of Oral Sciences (conf. plénière)

From ganoid to elasmoid scales in the actinopterygian fishes: new phylogenetic data.
(1989) 3rd International Congress of Vertebrate Morphology, Anvers, Belgique. (Key note lecture)

Communications in proceedings [Top]
1-Sire JY, 1982. Dynamique de la minéralisation des écailles d'un Cichlidé africain, Hemichromis bimaculatus. Journées Soc. Zool. Fr, Paris. Bull. Soc. Zool. Fr., 108(4): 695. (poster)
2-Sire JY, Geraudie J., 1985. Ultrastructure des scléroblastes au cours des premiers stades de la régénération du "contre-plaqué" collagénique des écailles d'un poisson téléostéen Hemichromis bimaculatus (Cichlidés, Perciformes). Journées du "Club Régénération", Soc. Fr. Biol. Dévt, Créteil, France. Arch. Anat. micr. Morphol. expér., 74 (4): 282-283. (poster)
3-Sire JY, Meunier F.J., Geraudie J., Zylberberg L., 1986. On the origin of the ganoine in the scales of Calamoichthys. 2nd Intern. Congress Vert. Morph.", Vienne, Autriche. Fortsch. Zool., 35: 482-483. (poster)
4- Huysseune A., Sire JY., 1989. TEM observations on chondroid bone in Hemichromis bimaculatus (Teleostei, Cichlidae). 3rd Intern. Congress Vert. Morphol., Anvers, Belgique. Ann. Soc. Roy. Zool. Belg., 119(Suppl.1): 75. (poster)
5- Huysseune A., Sire JY., Verraes W., 1989. Developmental changes in the anterior part of Meckel's cartilage in cichlid fish. 3rd Intern. Congress Vert. Morphol., Anvers, Belgique. Ann. Soc. Roy. Zool. Belg., 119(Suppl.1): 54. (oral)
6- Huysseune A.,Sire JY, 1992. Developmental interactions between cartilage, bone and teeth during early mandibular development in cichlids (Teleostei; Cichlidae). Anat. Anz., 175 (suppl.): 41. (oral)
7-Sire JY, Meunier F.J., 1994. Ultrastructure of the lining cells and their processes in holostean bone and teleostean acellular bone. 4th Int. Congr. Vertebrate Morphology, Chicago, 31 juillet au 4 août. J. Morphol., 220(3): 394-395 (abstract). (oral)
8-Sire JY, Huysseune A., 1994. Odontode development in an armoured catfish. 4th Int. Congr. Vertebrate Morphology, Chicago, 31 juillet au 4 août. J. Morphol., 220(3): 394 (abstract). (poster)
9- Huysseune A.,Sire JY, 1994. Lower pharyngeal jaw structure in two phenotypes of Astatoreochromis alluaudi (Teleostei: Cichlidae). 4th Int. Congr. Vertebrate Morphology, Chicago, 31 juillet au 4 août. J. Morphol., 220(3): 356 (abstract). (poster)
10- Gayet M., Meunier F.J., Sire JY., 1995. Approche phylogénétique des Polyptériformes (Pisces, Cladistia). Géobios, mém. spéc. 19: 193-196.
11- Huysseune A., Van Der Heyden C.,Sire JY., 1997. Development of first generation pharyngeal teeth in the zebrafish Danio rerio (Teleostei, Cyprinidae). 5th Int. Congr. Vertebrate Morphology, Bristol, UK, juillet. J. Morphol., 232(3): 267.
12-Sire JY, Huysseune A., 1997. A comparison of structure and development of teeth and odontodes in armoured catfish (Siluriformes, Callichthyidae). 5th Int. Congr. Vertebrate Morphology, Bristol, UK, juillet. J. Morphol., 232(3): 324.
13- Quilhac A., Sire JY., 1997. Re-epithelialization of large superficial wounds of the skin in the cichlid fish Hemichromis bimaculatus. 5th Int. Congr. Vertebrate Morphology, Bristol, UK, juillet. J. Morphol., 232(3): 311.
14- Sire JY., Quilhac A., Akimenko M.A., 1997. Spatial and temporal expression of sonic hedeghog during scale development and regeneration in the zebrafish. 5th Int. Congr. Vertebrate Morphology, Bristol, UK, juillet. J. Morphol., 232 (3): 324.
15- Delgado S., Davit-Béal T., Allizard F., Sire JY, 2004. Tooth development in a scincid lizard, Chalcides viridanus (Squamata),with particular attention paid on enamel formation. 7th Int. Congress of Vert. Morphol., Boca Raton, Florida, USA, Juillet. J. Morphol.
16- Davit-Béal T., Sire JY, 2004. Morphological variations in a tooth family through ontogeny in Pleurodeles waltl (Amphibia, Caudata). 7th Int. Congress of Vert. Morphol., Boca Raton, Florida, USA, Juillet. J. Morphol.
17- De Bakker M.A., Nelemans B.K., Sire JY, Richardson M.K., 2007. Digit identity - a comparative developmental approach. ICVM8, Paris, July. J. Morphol.
18- Deschamps M.-H., Girondot M., Labbé L, Sire JY 2007. Vertebral structure modifications during growth of farming rainbow trout. ICVM8, Paris, July. J. Morphol.
19- VICKARYOUS M.K., HUYSSEUNE A., Sire JY, 2007. Comparative development of mineralized integumentary elements. ICVM8, Paris, July. J. Morphol.
20- DAVIT-BÉAL T., SIRE J.Y., 2007. Enameloid/enamel transition through successive tooth replacements in Pleurodeles waltl (Lissamphibia, Caudata). ICVM8, Paris, July. J. Morphol.
21- Al-Hashimi, N., Delgado, S., Sire JY, 2007. Mammalian enamelins: identification of conserved regions, evolution mode and made use for validation of mutations leading to amelogenesis imperfectca. European Cells and Materials, 14, suppl 2: 67.
22- Delgado, S., Al-Hashimi, N., Sire JY, 2007. Evolutionary analysis of DMP1. European Cells and Materials, 14, suppl 2: 10.

Communications with no proceedings [Top]
1- FRANCOIS Y., MEUNIER F.J.,Sire JY, 1984. Radiations adaptatives et tendances évolutives des Téléostéens. Journées Zoologiques franco-italiennes (U.Z.I. et S.Z.F.). Padoue, Italie. (poster)
2- MEUNIER F.J.,Sire JY, FRANCOIS Y., 1984. Les écailles des Actinoptérygiens. Journées Zoologiques franco-italiennes (U.Z.I. et S.Z.F.). Padoue, Italie. (poster)
3- Sire JY, 1984. The deep scleroblast of the regenerating teleost scale: a model of cell producing a collagenic plywood. 1rst Intern. Congrès on Biology of Invertebrate and Lower Vertebrate collagens, Côme, Italie. (poster)
4- VILLIERS L., Sire JY, 1985. Growth and determination of individual age of Turbo setosus (Prosobranchia Turbinidae), Hao atoll (Tuamotu, French polynesia). Vth Intern. Coral Reel Congress, Tahiti. (oral)
5- ZYLBERBERG L., BEREITER-HAHN J., Sire JY, 1986. Relationships between the direction of the collagen fibrils and the organization of the cells in elasmoid scales. XVth Meeting of F.E.C.T.S., Manchester, Grande Bretagne. (poster)
6- MEUNIER F.J., GAYET M., GERAUDIE J., Sire JY, ZYLBERBERG L., 1988. Données ultrastructurales sur la ganoine du dermosquelette des Actinoptérygiens primitifs. VIIth Intern. Symp. on Dental Morph., Paris, 1986. (oral)
7- Sire JY, 1988. Squamation chronology and scale development in two cichlids, Hemichromis bimaculatus and Cichlasoma octofasciatum. IVth Workshop on Biol. Ecol. Conserv. Cichlids, Bielefeld, RFA. (oral)
8- Sire JY, 1988. Comparison of scale development during ontogeny and regeneration in the cichlid Hemichromis bimaculatus: origin of scale regenerating cells. VIth Congress Europ. Ichtyol. Budapest, Hongrie. (oral)
9- HUYSSEUNE A., Sire JY, 1994. Pharyngeal tooth development and replacement in relation to dietary changes in cichlid fishes. 5th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Rolduc, Pays-Bas, 4 au 8 mai. (poster)
10- Sire JY, 1994. Ganoine formation in the scales of primitive Actinopterygian fishes, lepisosteids and polypterids. 5th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Rolduc, Pays-Bas, 4 au 8 mai. (poster)
11- Sire JY, MEUNIER F.J., 1994. Structure, développement et croissance des plaques dermiques de quelques siluriformes cuirassés. BASILE, Montpellier, mai 94 (poster)
12- Sire JY,1994. Tissus dentaires et dermosquelette écailleux chez les Actinoptérygiens actuels. Journées annuelles de la Société Zoologique de France, Nancy, 4-6 juillet 94.(oral)
13- Sire JY, 1994. Formation de la ganoïne dans les écailles des Actinoptérygiens primitifs. Journées annuelles de la Société Zoologique de France, Nancy, 4-6 juillet 94.(poster)
14- QUILHAC A., Sire JY, 1994. Démonstration expérimentale du rôle de l'épiderme lors de la régénération des écailles élasmoïdes des Téléostéens. Journées annuelles de la Société Zoologique de France, Nancy, 4-6 juillet 94. (poster)
15- Sire JY, MEUNIER F.J., 1994 Structure comparée des plaques dermiques chez quelques Siluriformes cuirassés. Journées annuelles de la Société Zoologique de France, Nancy, 4-6 juillet 94. (poster)
16- QUILHAC A., Sire JY., 1995. Epidermal-dermal interactions during the healing process of large superficial wounds in fish. European Developmental Biology Congres, Toulouse, juillet.(poster)
17- KOUMANS J.,Sire JY, 1995. A serum free, chemically defined organ culture system to study in vitro development and growth of dermal skeleton in fish. European Developmental Biology Congres, Toulouse, juillet.(poster)
18- Sire JY., BOURGUIGNON J., 1995. Zebrafish scale development. European Developmental Biology Congres, Toulouse, juillet.(poster)
19- HUYSSEUNE A., KOUMANS J.,Sire JY, 1995. In vitro tooth and jaw development in two teleostean fish, Hemichromis bimaculatus and Danio rerio. European Developmental Biology Congres, Toulouse, juillet. (poster)
20- HUYSSEUNE A.,Sire JY, VAN DER HEYDEN C., 1997. Initiation of cichlid and zebrafish first generation teeth studied by in vitro culture. 6th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Goteborg, Suède, juin. (poster)
21- Sire JY, QUILHAC A., 1997. Odontodes and odontode-derived tissues in living vertebrates. Evolutionary hypotheses, recent results, and challenges for the near future. 6th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Goteborg, Suède, juin. (poster)
22- Sire JY., MARIN S. & ALLIZARD F., 1998. Tooth and odontode (extra-oral tooth) structure in the teleost fishDenticeps clupeoides. 6th Int. Conf. on the Chemistry and Biology of Mineralized Tissues. Vittel, France, novembre (poster)
23- DELGADO S., Sire JY., GIRONDOT M., 1998. Evolutionary analysis of non-mammalian amelogenin genes. 6th Int. Conf. on the Chemistry and Biology of Mineralized Tissues. Vittel, France, novembre (poster)

24- Sire JY., DELGADO S., BONNAUD L., 1999. L’évolution du squelette dermique des vertébrés. L’apport des études comparatives structurales et développementales à la reconnaissance d’homologies. 2èmes Journées Françaises de la Biologie des Tissus Minéralisés. Versailles, France, mars.
25- DELGADO S., Sire JY., GIRONDOT M., 1999. Apports phylogénétiques à l’analyse structurale et fonctionnelle des amélogénines. 2èmes Journées Françaises de la Biologie des Tissus Minéralisés. Versailles, France, mars.
26- GIRONDOT M., DELGADO S.,Sire JY., LAURIN M., 1999. Datation moléculaire de l'acquisition de matrices des tissus minéralisés chez les Vertébrés. 2èmes Journées Françaises de la Biologie des Tissus Minéralisés. Versailles, France, mars.
27-Sire JY QUILHAC A., AKIMENKO M.A., 1999. Sonic hedgehog expression during scale development and regeneration in zebrafish. 1st Europ. Meeting on zebrafish genetics and development, Tuebingen, Allemagne, mars (poster).
28- VAN DER HEYDEN C., HUYSSEUNE A., Sire JY., AKIMENKO M.A., 1999. Expression of msx-genes in developing teeth of zebrafish. 1st Europ. Meeting on zebrafish genetics and development, Tuebingen, Allemagne, mars (poster).
29-Sire JY, 1999. Evolutionary origins of odontodes in living vertebrates. Major events in early vertebrate evolution - Paleontology, phylogeny and development, Londres, UK, avril (poster)
30- SFEIR C., BUTLER S., Sire JY., LIN E., VEIS A., 1999. Dentin phosphoproteins in zebrafish. International Association of Dental Research, Vancouver, Canada, mars (poster).
31-Sire JY, 1999. The evolutionary origins of the odontodes in living vertebrates. COST B8 “Odontogenesis” meeting. Evolution. Gand, Belgique, septembre (oral).
32- DELGADO S., GIRONDOT M., Sire JY., 1999. Evolutionary analysis of non-mammalian amelogenine genes. COST B8 “Odontogenesis” meeting. Evolution. Gand, Belgique, septembre (oral).
33- BONNAUD L., Sire JY., 1999. Fish scale proteins: evolutionary relationships with dental proteins. COST B8 “Odontogenesis” meeting. Evolution. Gand, Belgique, septembre (oral).
34- ARNULF I., Sire JY., 2000. Structure et développement des épines cténiales des écailles d’un poisson téléostéen, le cichlidé Cichlasoma nigrofasciatum. 1ères Rencontres de l’Ichtyologie en France, Paris (mars).
35- VAN DER EYDEN C., HUYSSEUNE A., Sire JY., 2000. Développement des dents du poisson zèbre (Danio rerio). 1ères Rencontres de l’Ichtyologie en France, Paris (mars).
36- DELGADO S., ISHIYAMA M., Mikami M., Imai A., ShiMomura H.,Sire JY., 2001. Evolutionary and phylogenetic analyses of amelogenin genes in amniotes. 7th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Lalonde-les-Maures, France, juin. (oral)
37- VAN DER EYDEN C., Sire JY., HUYSSEUNE A., 2001. In vitro odontogenesis in a polyphyodont species, the zebrafish. 7th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Lalonde-les-Maures, France, juin. (poster)
38- ZALZAL S., FORTIN F., Sire JY., ZYLBERBERG L., CASTANET J., NANCI A., 2001. Immunolocalization of amelogenin and ameloblastin in the lizard Chalcides sexlineatus (Scincidae). 7th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Lalonde-les-Maures, France, juin.
39- VERREIJDT L., VANDERVENNET E.,Sire JY, HUYSSEUNE A., 2001. Developmental differences between cranial bones in the zebrafifsh (Danio rerio) : some preliminary light and TEM observations. 7th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, Lalonde-les-Maures, France, juin.
40- DELGADO S., Sire JY., 2002. Analyse évolutive des gènes de l’amélogénine chez les mammifères. 5èmes Journées Françaises de la Biologie des Tissus Minéralisés. Montrouge, France, mai.
41- Davit-Béal T., Delgado S., Huysseune A., Sire JY., 2002. Les dents de première génération des vertébrés non mammaliens ont-elles conservé un caractère ancestral? 5èmes Journées Françaises de la Biologie des Tissus Minéralisés. Montrouge, France, mai.
42- Huysseune A., Sire JY., 2002. Fish dentitions: larval common features versus adult specializations. Ecology, evolution and ethology, Québec, Canada.

43- DAVIT-BEAL T.,Sire JY, 2003. Modifications de certaine scaractéristiques dentaires au cours de l’ontogenèse d’un tétrapode polyphyodonte, Pleurodeles watl (amphibien urodèle). 6èmes Journées Françaises de la Biologie des Tissus Minéralisés. Nice, France, juin.
44- VAN DER HEYDEN C.,Sire JY, HUYSSEUNE A., 2003. Development of the zebrafish dentition in vitro reveals possible clues for understanding polyphyodonty. European Zebrafish and Medaka Meeting, Paris, Juin.
45- VERREIJDT L., VAN DER HEYDEN C., BORDAY V.,Sire JY, HUYSSEUNE A., 2003. Dlx expression in the zebrafish cranial skeleton. European Zebrafish and Medaka Meeting, Paris, Juin.
46- HUYSSEUNE A., THAERON C., LAURENTI P., Sire J., 2003. eve1 involvement in initial patterning of zebrafish Teeth and terminal ameloblast differentiation. European Zebrafish and Medaka Meeting, Paris, Juin.
47- CHISAKA H.,Sire JY, KOZAWA Y., 2003. Development of first generation tooth in Xenopus laevis. Morphological and cytochemical studies. The 45th Annual Meeting of Japanese Association for Oral Biology. September 18 - 19, 2003. Morioka, Japan.

48- Davit-Béal T., Sire JY, 2004. Tooth development and morphological variations through ontogeny in the amphibian, Pleurodeles waltl. 8th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, York, UK, juillet.
49- DELGADO S., DAVIT-BÉAL T., COUBLE M.-L., ALLIZARD F., Sire JY, 2004. Dentition pattern, tooth development and amelogenin expression in the lizard, Chalcides viridanus (Scincidae, Squamata). 8th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, York, UK, juillet
50- Huysseune A., Laurenti P., Thaëron C., Allizard F.,Sire J., 2004. Expression of the even skipped-related gene eve1 suggests its requirement in initiation and morphogenesis of the first tooth, and in the differentiation of the ameloblasts in the zebrafish (Danio rerio). 8th Int. Conf. Tooth Morphogenesis and Differentiation, York, UK, juillet
51- Delgado S., Davit-Béal T., Fromentin D., Girondot M., Sire JY, 2004. The evolutionary analysis of dental proteins: A new tool to validate genetic anomalies. An example with the amelogenin, the major protein of forming enamel. Meeting European COST action B23, Gand, Mars.

52- Sire JY, DELGADO S., Girondot M. 2005. The reasons why chicken can no longer have true teeth. Meeting European COST action B23, Barcelona, May.
53- Sire JY, DELGADO S., Girondot M. 2005. The Amelogenin Story: Origin, Evolution and Validation of Mutations in Human. Enamel VII Conference, Boston, Cape Cod, April.
54- Sire JY, DELGADO S., Girondot M. 2005. True teeth will never be resuscitated in birds. 9th Evolutionary Biology Meeting, Marseille, Septembre.

55- Verreijdt L., Debiais-Thibaud M., Borday-Birraux V.,Sire JY, Huysseune A. 2006. Expression of the dlx family genes during formation of the cranial bones in the zebrafish (Danio rerio): differential involvement in the braincase and visceral skeleton. Meeting European COST action B23, Helsinki, April.
56- de Bakker M.A.G., Sire JY, Binot A.J.M.F., Dondorp E.M., Thomassen H.A., Nelemans B.K.A., Vonk F.J., Richardson M.K. 2006. Gene expression in the developing tetrapod limb: a comparative study. 1st Evo Devo meeting, Prague, August.
57- DESCHAMPS M.-H.,Sire JY 2006. Étude histomorphométrique du squelette vertébral de la truite d’élevage française. RIF 2006, Paris, mars.
58- DESCHAMPS M.-H., GIRONDOT M., Sire JY, 2006. Qualité et structure du tissu osseux vertébral chez la truite d’élevage française. Troisième Congrès Franco-tunisien de Zoologie, Tabarka-Tunisie, Novembre.
59- Delgado S., Al-Hashimi N., Davit-Béal T., Sire JY, 2006. A spot light on enamelin: evolutionary genetics brought new insights into the role of different sites of the protein. COST B23, Paris, Nov.

60- Sire JY, Richard B., Delgado S., 2007. A study of amelogenin polymorphism in humans and validation of x-linked amelogenesis imperfecta inferred from evolutionary analysis. COST B23, Barcelona, June.
61- Deschamps, M.-H., Labbé L., Baloche S., Dufour S., Fouchereau-Péron M., Kacem A., Meunier F., Sire JY, 2007. Effets de l'activité de nage sur la qualité du tissu osseux vertébral et sur certains paramètres sériques du métabolisme phosphocalcique de la truite arc-en-ciel. JFBTM-10, Amiens, mai.
62- Delgado S., Richard B., Sire JY, 2007. Etude du polymorphisme de l'amélogénine et utilisation de l'analyse évolutive pour la validation des mutations conduisant à l'amélogenèse imparfaite. JFBTM-10, Amiens, mai.
63- Davit-Béal T., Sire JY, 2007. Transition émailloïde/émail au cours des remplacements dentaires successifs chez le pleurodèle, Pleurodeles waltl (Lissamphibien, Caudate). JFBTM-10, Amiens, mai.
64- Al-Hashimi N., Delgado S., Sire JY, 2007. L’énaméline des mammifères : mise en évidence de régions conservées, mode d’évolution et aide à la validation de mutations conduisant à l’amélogenése imparfaite. JFBTM-10, Amiens, mai.
65- Bardet C., Sire JY, 2007. Analyse évolutive de MEPE. JFBTM-10, Amiens, mai.
66- Al-Hashimi N., Delgado S.,Sire JY, 2007. Mammalian enamelins: identification of conserved regions, evolution mode and made use of for validation of mutations leading to amelogenesis imperfecta. TMD Conference, Zurich, Sept.
67- Delgado S., Al-Hashimi N., Sire JY, 2007. Evolutionary analysis of DMP1. TMD Conference, Zurich, Sept.
68- Bardet C., Sire JY, 2007. Evolutionary analysis of MEPE. ICCBMT, Austin, USA, Nov
69- Al-Hashimi N., Delgado S., Sire JY, 2007. New insights into the function of enamelin regions using an evolutionary approach. ICCBMT, Austin, USA, Nov

70- Deschamps M.D., Girondot, M., Labbé, L., Sire JY, 2009. Changes in vertebral structure during growth of reared rainbow trout, Oncorhynchus mykiss (Walbaum): a new approach using modeling of vertebral bone profiles. Interdisciplinary Approaches in Fish Skeletal Biology, Faro, Portugal, Apr
71- Huysseune A., Sire JY., Witten P.E., 2009. A revised hypothesis on the evolutionary origin of the vertebrate dentition. Interdisciplinary Approaches in Fish Skeletal Biology, Faro, Portugal, Apr
72- Bardet C., Jaffrédo, T., Sire JY., 2009. MEPE/OC116 : un acteur commun de la minéralisation des tissus osseux et de la coquille d’œuf. JFBTM-11, Nice, Mar.
73- Assaraf-Weill, N., Al-Hashimi, N., Bardet, C., Delgado, S., Sire JY, Davit-Beal, T., 2009. Caractérisation du gène de l’amélogénine chez Pleurodeles waltl (Lissamphibia, Caudata) et son expression lors de l’odontogenèse chez la larve, le juvénile et l’adulte. JFBTM-11, Nice, Mai.
74- Deschamps, M.-H., Girondot, M., Labbé, L., Sire JY., 2009. Changements structuraux des vertèbres lors de la croissance de la truite d’élevage : une nouvelle approche utilisant la modélisation des profils de compacité osseuse. RIF 2009, Paris, Mar.
75- Deschamps, M.-H., Girondot, M., Labbé, L., Sire JY., 2009. Changes in vertebral structure during growth of reared rainbow trout, Oncorhynchus mykiss (Walbaum): a new approach using modeling of vertebral bone profiles. Interdiciplinary Approaches in Fish Skeletal Biology, Faro, Portugal, Apr
76- Danion, M., Deschamps, M.H., Thomas-Guyon, H., Bado-Nilles, A., Le Floch, S., Quentel, C.,Sire JY, 2009. Environnement et histomorphologie : effet in vivo d’une pollution de type hydrocarbure sur la qualité du tissu osseux vertébral chez le bar commun, Dicentrarchus labrax. 2èmes journées de la recherche filière piscicole, Paris, juil.

77- Silvent, J., Vigier, S., Sire, J.-Y., Giraud-Guille, M-M., 2010. Human osteoblast behavior on dense fibrillar collagen matrices. VIIIth Annual Meet. Fr. Soc.of the Extracellular Matrix Biology, Paris, Mar.
78- Silvent J., Giraud-Guille, M.M., Sire, J.-Y., 2010. Morphologie, minéralisation et expression génique d'ostéoblastes primaires humains sur matrice dense de collagène. JFBTM12, St-Etienne, Jun., Oral
79- Bardet C., Lajarille, C., Sire, J.-Y., 2010. Expression de MEPE/OC-116 dans les cellules osseuses et les odontoblastes du lézard Anolis carolinensis (Sauropside), et nouvelles données évolutives de ce gène chez les amniotes. JFBTM12, St-Etienne, Jun., Oral
80- Buffrénil V.de, Dauphin Y., Rage J.C., Sire J.-Y., 2010. Enamel-like tissue on the osteoderms of a glypotosaurine (Squamata : Anguidae) lizard. Perpectives on vertebrate evolution: topics and problems. Collège de France, Jun, Paris, Oral.
81- Delgado, S., Al-Hashimi, N., Lafont, A.-G., Kawasaki, K., Sire, J.-Y., 2010. Evolutionary analysis of enamelin in mammals, sauropsids and amphibians provides new insights on its function. 10thTMD, Berlin, Sept. Oral.

82- Silvent J., Sire, J.-Y., Giraud-Guille, M.M., 2011. Human primary osteoblasts cultured on dense fibrillar collagen matrices: morphology, mineral deposition and gene expression. Hybrid Materials
83- Gasse B., Al-Hashimi N., Sire, J.-Y., 2011. Origine, évolution et expression d'une nouvelle protéine de l'émail, l'amélotine. 13èmes JFBTM, Paris, Mai (oral).
84- Le Roy N., Gaume B., Marie B., Guichard N., Delgado S., Zanella-Cleon I., Becchi M., Auzoux-Bordenave S., Sire, J.-Y., Marin F., 2011. Identification de deux anhydrases carboniques dans le manteau de l’ormeau européen Haliotis tuberculata (Gastropoda, Haliotidae): Implications phylogénétiques. 13èmes JFBTM, Paris, Mai (oral).
85- Silvent J., Nassif N., Azais T., Giraud-Guille M.-M., Sire J.-Y., 2011. Comportement et expression génique d'ostéoblastes primaires humains des matrices fibrillaires denses de collagène et minéralisation à J 60. 13èmes JFBTM, Paris, Mai (oral).
86- Bédouet L., Marie A., Berland S., Marie B., Marin F., Sire J.-Y., Milet C., 2011. Identification de protéines constitutives des structures biominéralisées par couplage de données de transcriptomique et protéomique : application aux protéines matricielles des coquilles de mollusques. 13èmes JFBTM, Paris, Mai (affiche).
87- Tabka H., Assaraf-Weill N., Sire J.-Y.,, Davit-Béal T., 2011. Avantages d’un modèle non mammalien, la salamandre, Pleurodeles waltl, pour l’étude de l’odontogenèse. 13èmes JFBTM, Paris, Mai (affiche).
88- Belheouane M., Sire J.-Y., Delgado S., 2011. Les gènes de minéralisation de l’émail chez les reptiles :Evolution et comparaison avec les mammifères. 13èmes JFBTM, Paris, Mai (affiche).
89- Serra A.-A., Sire J.-Y.,, Roche H., Girondot M., 2011. La vertèbre de truite comme biomarqueur intégrateur du stress écotoxicologique. 13èmes JFBTM, Paris, Mai (affiche).
90- Bourdon B., Deschamps M.H., Vandenberg G.W., Sire J.-Y., 2011. Is there an effect of dietary P deprivation on vertebrae internal structure of farmed rainbow trout ? Colloque de l'Institut de Biologie des Systèmes Intégrés (IBIS), Québec, Sept (affiche)
91- Bourdon B., Deschamps M.H., Sire J.-Y., Vandenberg G.W., 2011. Is there a best tool using morphometrics and biomechanics for studying the effect of P deprivation? Colloque de l'Institut de Biologie des Systèmes Intégrés (IBIS), Québec, Sept (affiche)
92- GibbG.C., Sérol1 D, Tibi A., Tilak M.K., Sire J.-Y.,, Delsuc F., 2011. Retracing the gene, corigins of enamel loss during the evolutionary history of Xenarthran mammals. ESEB, Tubingen, Sept (affiche)

93- Gasse, B., Mornet, E., Sire J.-Y., 2012. Evolutionary analysis of ALPL validates and predicts human mutations leading to hypophosphatasia. Huningue, May (oral)
94- Silvent, J., Sire J.-Y., Delgado S., 2012. Analyse évolutive de DMP1 : de nouvelles hypothèses fonctionnelles. 14èmes JFBTM, Bordeaux (Oral)
95- Gasse, B., Mornet, E., Sire J.-Y., 2012. L'étude évolutive de la phosphates alcaline osseuse permet de valider et de prédire les mutations responsables de l'hypophosphatasie. 14èmes JFBTM, Bordeaux (Oral), Prix du meilleur oral.

96- Silvent J, Nassif N, Azaïs T, Helary C, Delgado S, Soncin F, Giraud Guille MM, Sire JY. 2013. Mineralizing properties of DMP1 studied in vitro with cellular and acellular 3D collagen model systems mimicking the bone tissue. European Calcified Tissue Society, Barcelone, Mai (affiche)
97- Deschamps MH, Bourdon B, Le Luyer J, Poirier Stewart N, Proulx E, Sire JY. Witten PE, Bureau D, Vandenberg GW, 2013. The effects of dietary P level on vertebral metabolism in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Interdisciplinary Approaches in Fish Skeletal Biology (IAFSB), Tavira, Portugal, Avril (Oral)
98- Leprévost A, Brunel O, Sire JY. 2013. Implementing a study on reared Siberian sturgeon Acipenser baeri axial deformities: first observations. Interdisciplinary Approaches in Fish Skeletal Biology (IAFSB), Tavira, Portugal, Avril (Oral)
99- Leprévost A, Brunel O, Sire JY. 2013. Mise en place d'une étude sur les déformations axiales chez l'esturgeon sibérien Acipenser baeri. Journées de la Société Française d'Ichtyologie, Perpignan, Mai (poster).
100- Witten PE, Sire JY. Huysseune A, 2013. Old, new and new-old concepts about the evolution of teeth. Interdisciplinary Approaches in Fish Skeletal Biology (IAFSB), Tavira, Portugal, Avril (Oral)
101- Gasse B, Sire JY. 2013. History of an enamel protein, amelotin, that experienced distinct evolutionary pathways in the tetrapod lineages. 11th International Conference on Tooth Morphogenesis and Differentiation, Lalonde les Maures, Mai (oral)
102- Witten PE, Sire JY., Huysseune A, 2013. Circumnavigation: Old meet new concepts about the evolutionary and developmental origin of teeth. 11th International Conference on Tooth Morphogenesis and Differentiation, Lalonde les Maures, Mai (oral)
103- Sire JY. Gasse B, Silvent J, Delgado S, Belheouane M, Buffrénil V de, 2013. How did enamel matrix proteins evolve in reptile teeth and are they present in osteoderms? 10th International Congress of Vertebrate Morphologists, Barcelona, Spain (Oral)
104- Gasse B, Delsuc F, Sire JY., 2013. Analyse évolutive de l'améloblastine chez les mammifères. Journées Françaises de Biologie des Tissus Minéralisés, Poitiers, Mai (poster)
105- Silvent J, Gasse B, Sire JY. 2013. Apport de nouvelles données sur l’évolution des SCPPs par l’étude d’un transcriptome de mâchoire de crocodile associée à celle d’un génome. Journées Françaises de Biologie des Tissus Minéralisés, Poitiers, Mai (Oral)

My theses [Top]
Es-science Doctor (HDR)
Structure, formation et régénération des écailles d'un poisson téléostéen, Hemichromis bimaculatus (Perciforme, Cichlidé).
Sire JY
(1987) Thèse de Doctorat ès-Sciences, Université Paris VII. Archives et Documents de l'Institut d'Ethnologie, Micro-édition, Mus. Nat. Hist. Nat., SN 87 600 449, 261 pp.

PhD
Développement, croissance et régénération des écailles d'Hemichromis bimaculatus (Gill, 1862) (Perciformes, Cichlidés).
Sire JY
( 1980) Thèse 3ème Cycle en Biologie, Université Paris VII. Archives et Documents de l'Institut d'Ethnologie, Micro-édition, Mus. Nat. Hist. Nat., SN 80-601-271, 80 pp.

PhD supervisor [Top]
1- Alexandra Quilhac: Boursière MRT, 1994/1997: Etude des intéractions épidermo-dermiques lors de la régénération des écailles. Current job: MCU, UPMC.

2- Sidney Delgado: Boursier puis ATER, Collège de France. 1998/2001. Clonage, expression et évolution du gène de l’amelogénine chez les squamates (reptiles). Current job: MCU, UPMC

3- Tiphaine Davit-Béal: Assistante Univ. Paris 5 (Dentaire), 2000-2006. L’amélogenèse chez les amphibiens urodèles. Current job: MCU-PH, Univ. P5.

4- Marie-Hélène Deschamps: Contrat OFIMER/IFOP, 2005-2008. Impact des facteurs environnementaux et physiologiques sur rels caractéres histomorphométriques du squelette axial de la truite d'élevage. Current job: Post-doctoral position at Univ. Laval, Québec, Canada.

5- Claire Bardet: Boursière IFRO. 2006-2009. La phosphoglycoprotéine de la matrice extracellulaire (MEPE) – Origine, évolution, et fonctions chez les vertébrés. Thesis defended dec 2009.

6- Nawfal Al-Hashimi: Boursier Irakien, Ministère Affaires étrangères. 2006-2009. Etude évolutive de l'énaméline, protéine de l'émail dentaire des vertébrés. Thesis to be defended on Spring 2010.

7- Nathalie Assaraf-Weill: Assistante Univ. aAris 5 (Dentaire, 2009-2012). Amélogenèse chez Pleurodeles waltl: expression des gènes de l'émail.

8- Jérémie Silvent: Boursier MRT, 2009-2012. Co-direction avec M.-M. Giraud-Guille. Minéralisation de matrices collagéniques 3D; protéines minéralisantes.

9- Benjamin Bourdon: Co-tutelle Québec, 2010-2013. Co-direction avec G. Vandenberg, Univ. Laval. Squelette truite en élevage.

10- Barbara Gasse: Thèse contrat CNRS. dec2011-... Evolution des protéines de la matrice de l'émail

11- Amandine Leprévost: Thèse Cifre, jan2013-... Développement de l'axe vertébral de l'esturgeon et malformations.

Post-Doct fellows [Top]
1- Joseph Koumans: Netherlands, Wageningen. 2 years: 1994-1995. In vitro culture of scales, teeth, fins of zebrafish.

2- Hideki Chisaka: Chiba, Japan. 2 years: 2002-2003. Amelogenin, ameloblastin and tooth development in xenopus.

3- Anne-Gaelle Laffont: Concarneau, France, Projet cariogène. 3 years: 2008-2010.

4- Jérémie Silvent: UPMC, Projet ANR Jaws, 1 year: 2013

Societies [Top]
Société Française d’Ichtyologie
1980: Member
1986-... Member of Executive Committee,
1987-... Editor in Chief of Cybium, International Journal of Ichthyology

Société Zoologique de France :
1982: Member
1996-1998: Member of Executive Committee

Société Française de Biologie du Développement
1994-...: Member

International Society of Vertebrate Morphology
1994: Member
2001-... Member of Executive Committee (Treasorer)

Société Française de Biologie des Tissus Minéralisés
1998: Member
2002-2010: Member of scientific committee
2011-...: Member